اعدام منافقین مدتی است که با توجه به انتشار برخی از فایل‌های سخنرانی آیت الله منتظری مورد توجه رسانه‌ها و بهانه‌ای برای هجمه به نظام و امام خمینی (ره) قرار گرفته است که لازم دیدم مرور کوتاهی به قضیه اعدام منافقین داشته باشم:
پس از این که منافقین علیه نظام وارد عملیات مسلحانه شدند، بخشی از این جریان از کشور فرار کردند و به صدام پیوستند و بخشی نیز زندانی شدند که با توجه به فاز مسلحانه بودن حرکت شان، از همان ابتدا هم اگر اعدام می‌شدند واقعا جای گلایه و اعتراض نداشت، لیکن با گذشت نظام تنها زندانی شدند و این در حالی بود که در تمام این مدت سازمان منافقین با صدام همکاری داشتند و عملیات‌های تروریستی زیادی را نیز در داخل کشور انجام دادند.
پس از انجام عملیات منافقین علیه نظام جمهوری اسلامی ایران با عنوان «فروغ جاویدان» با همکاری ارتش صدام در سال ۱۳۶۷ که با عملیات ارتش جمهوری اسلامی ایران با عنوان «مرصاد» مواجه و به شکست انجامید، مشخص گردید که بخشی از منافقین از داخل زندان‌ها با عملیات هماهنگ بودند تا پس از اشغال هر شهر به نیروهای منافقین بپیوندند و در نهایت در حمله به تهران شرکت کنند که قبل از آغاز عملیات تلاش کردند تا هم طیفان خود را برای آن آماده نمایند.
از سوی دیگر خود مسعود رجوی، فرمانده منافقین، ۳ روز قبل از آغاز عملیات می‌گوید:
«براساس تقسیمات انجام شده، ۴۸ ساعته به تهران خواهیم رسید… از پایگاه نوژه هم ترسی نداشته باشید؛ هر سه ساعت به سه ساعت دستور می‌دهم هواپیما‌های عراقی بیایند و آنجا را بمباران کنند. پایگاه هوایی تبریز را هم با هواپیما هر سه ساعت به سه ساعت مورد هدف قرار خواهیم داد… از طرفی درب زندان‌ها که باز شود آن‌ها هم با ما هستند و با ما همراهی خواهند کرد. نیروهای زندان بالقوه با ما هستند.»
که این شرایط موجب شد تا براساس نظر شخص امام خمینی (ره)، پرونده این افراد مجدداً بررسی گردد تا در صورت وجود رابطه با عملیات مزبور، به عنوان محارب مجازات شوند. اما اعدام منافقین از نظر افرادی مانند آیت الله منتظری که منافقین در بیت او نفوذ کرده بودند و امیرارجمند، سخنگوی موسوی مورد اعتراض قرار گرفت و حال این که جنایات منافقین چه در مبارزه مسلحانه با نظام، چه در همکاری با صدام در جنگ و چه در ترور‌های گسترده علیه مسئولان بلند پایه نظام و مردم عادی، جای دفاع نداشت، خصوصاً این که اعدام منافقین به دلیل ادامه همکاری زندانیان با سازمان منافقین در محاربه با اسلام، مسلمین و نظام اسلامی انجام شد!
